Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NipblQ6KCD5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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NipblQ6KCD5 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NipblQ6KCD5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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