Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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CltbQ6IRU5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CltbQ6IRU5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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