Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tpm4Q6IRU2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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