Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdzrn3Q69ZS0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pdzrn3Q69ZS0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pdzrn3Q69ZS0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pdzrn3Q69ZS0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pdzrn3Q69ZS0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pdzrn3Q69ZS0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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