Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Msl2Q69ZF8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Msl2Q69ZF8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Msl2Q69ZF8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
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Msl2Q69ZF8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Msl2Q69ZF8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms