Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CltcQ68FD5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CltcQ68FD5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms