Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ino80dQ66JY2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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