Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctnna3Q65CL1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms