Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp7bQ64446 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms