Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Ccdc18Q640L5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc18Q640L5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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