Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Col4a5Q63ZW6 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms