Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hes3Q61657 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hes3Q61657 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms