Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ctf1Q60753 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ctf1Q60753 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ctf1Q60753 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms