Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tcf4Q60722 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms