Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Samhd1Q60710 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Samhd1Q60710 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms