Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prdm1Q60636 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms