Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CttnQ60598 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms