Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Trim38Q5SZ99 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Trim38Q5SZ99 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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