Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Med13Q5SWW4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Med13Q5SWW4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms