Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NacadQ5SWP3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms