Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shank3Q4ACU6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Shank3Q4ACU6 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shank3Q4ACU6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shank3Q4ACU6 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shank3Q4ACU6 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shank3Q4ACU6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shank3Q4ACU6 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shank3Q4ACU6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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