Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9Q3V038 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms