Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm28047Q3US59 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm28047Q3US59 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm28047Q3US59 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm28047Q3US59 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm28047Q3US59 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gm28047Q3US59 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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