Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms