Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms