Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Skap2Q3UND0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms