Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
E330014E10RikQ3UL33 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms