Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf224Q3UIW8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms