Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Atxn7l3bQ3UD01 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Atxn7l3bQ3UD01 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Atxn7l3bQ3UD01 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Atxn7l3bQ3UD01 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Atxn7l3bQ3UD01 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms