Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q3U595 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q3U595 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q3U595 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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