Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ulk3Q3U3Q1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ulk3Q3U3Q1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ulk3Q3U3Q1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ulk3Q3U3Q1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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