Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LcorlQ3U285 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LcorlQ3U285 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms