Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd1Q3TXS7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms