Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms