Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c3Q3TMP1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms