Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Usp39Q3TIX9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Usp39Q3TIX9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Usp39Q3TIX9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Usp39Q3TIX9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Usp39Q3TIX9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Usp39Q3TIX9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Usp39Q3TIX9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Usp39Q3TIX9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Usp39Q3TIX9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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Usp39Q3TIX9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Usp39Q3TIX9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Usp39Q3TIX9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp39Q3TIX9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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