Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms