Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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