Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim71Q1PSW8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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