Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms