Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms