Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc162pQ0VG85 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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