Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem52bQ0VBF2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem52bQ0VBF2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms