Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms