Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms