Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ncf1Q09014 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms