Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnn1Q08091 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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