Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
MestQ07646 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
MestQ07646 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MestQ07646 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MestQ07646 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MestQ07646 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MestQ07646 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
MestQ07646 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MestQ07646 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
MestQ07646 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms