Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cdx4Q07424 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms