Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gdf3Q07104 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gdf3Q07104 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms